Glutamina este deosebit de importantă pentru funcționarea intestinală normală, deoarece celulele mucoasei intestinale se regenerează folosind glutamina ca sursă principală de energie și, prin urmare, este adesea denumită de medici „restaurator intestinal”. Glutamina este recomandată în principal în cazurile de perturbare a integrității peretelui intestinal (cum ar fi în condiții de dezechilibru al florei intestinale sau în anumite boli cronice însoțite de tulburări ale funcției intestinale normale) și este adesea utilizată pentru recuperare de către sportivi, deoarece cantități mari de glutamină sunt stocate în mușchi, unde joacă un rol important în repararea și construirea de țesut muscular nou, deoarece antrenamentele intense pot epuiza rezervele de glutamină , motiv pentru care un supliment poate accelera restaurarea acestora.